机关单位日常保密工作由国家保密行政管理部门主管，本机关单位的保密委员会或保密工作领导小组具体负责实施。这一管理体制的确立，旨在构建职责明确、层级清晰、运行高效的保密责任体系，确保国家秘密安全，维护国家安全和利益。
从法律框架审视，我国以《中华人民共和国保守国家秘密法》为核心，辅以相关行政法规、部门规章及地方性法规，共同构成了机关单位保密工作的基本遵循。该法律体系明确规定了国家秘密的范围、密级、保密期限，以及机关、单位在保密管理中的基本职责与义务。法律授权国家保密行政管理部门对全国的保密工作实施指导、监督和检查，确立了其主管地位。与此同时，法律亦强调机关单位的主体责任，要求其建立内部保密管理制度，设立或指定专门机构负责日常保密工作。
在具体管理架构上，机关单位内部普遍设立保密委员会或保密工作领导小组，作为本单位保密工作的决策和领导机构。该机构通常由单位主要负责人牵头，相关职能部门负责人参与，其职责涵盖审定保密工作规划、研究解决重大保密问题、组织保密宣传教育与检查等。日常保密事务则由其下设的保密工作机构（如保密办公室）或指定的内设部门承担，负责制度落实、涉密人员管理、定密解密、涉密载体与信息系统防护等具体操作。这种设置体现了“业务谁主管，保密谁负责”的原则，将保密要求融入各项业务工作流程之中。
管理体制的运行依赖于若干关键机制。首要的是责任机制，通过签订保密责任书等形式，将保密责任层层分解，落实到具体岗位与人员。其次是教育培训机制，定期对全体工作人员，特别是涉密人员进行保密法律法规和知识技能培训，筑牢思想防线。第三是监督检查机制，包括单位内部自查、上级部门督查以及保密行政管理部门的行政检查，及时发现并堵塞漏洞。最后是奖惩与问责机制，对在保密工作中做出显著成绩的给予表彰，对发生泄密事件的依法依规追究责任。
当前，随着信息化与网络化的深入发展，保密管理面临新的挑战。管理体制亦需与时俱进，强化对计算机网络、移动存储介质、云计算等新兴领域的保密监管，推动技术防护与管理的深度融合。机关单位必须动态调整管理策略，不断提升人防、物防、技防的综合能力。
机关单位日常保密工作是在国家保密行政管理部门主管下，由本单位保密领导机构具体组织实施的系统性工程。其有效运转，既依赖于健全的法律法规与内部规章，也离不开清晰的组织架构、明确的责任分工以及常态化的教育、监督与问责机制。唯有坚持依法管理、综合防范，方能切实构筑起维护国家秘密安全的坚固屏障。